El mundo cayó por completo ante el Virus Metálico. Sonic the Hedgehog y sus amigos se encuentran en Angel Island, el último lugar seguro, trabajando junto a ningún otro que su viejo enemigo, el Dr. Eggman. Juntos, lanzarán un desesperado plan para derrotar a los Seis Letales y reclamar las Chaos Emeralds en un esfuerzo angustioso por salvar al mundo.
