Rintarou Okabe, mejor conocido como Okarin, es un estudiante de universidad que no ha madurado y presenta el síndrome chuunibyou. Formó un círculo de jóvenes investigadores para inventar artefactos del futuro, conformado por tres miembros. A través de los años habían desarrollado artefactos, sin embargo, cierto día, accidentalmente, crean una máquina del tiempo, con la cual se pueden enviar mensajes al pasado. Además, por azares del destino, conoce a Kurisu Makise, una niña genio. ¡Un gran acontecimiento mundial está por ocurrir y todos estarán involucrados!
